Technologija

Kaip sutelktinis finansavimas ir atvirojo kodo tyrimai kovos su vėžiu

Kokį Filmą Pamatyti?
 
Isaaco Yonemoto projekto Marilyn vėžio tyrimai

Šaltinis: Indysci.org

Ką atviro kodo tyrimų metodas reiškia vėžiui? Kaip sutelktinis finansavimas padės greičiau sukurti geresnius vaistus? Kaip mokslinių tyrimų projekto duomenų prieinamumas visiems atvers naujas galimybes tyrimams ir naujovėms? Nuo pat vaikystės programinę įrangą rašantis chemikas siekia išsiaiškinti.

Tyrėjas, vardu Isaacas Yonemoto, kai kurias atvirojo kodo programinės įrangos iniciatyvų koncepcijas taiko vėžio tyrimams. Yonemoto įsipareigoja Projektas „Marilyn“ , kampanija, kuria siekiama sukurti patentuotą vaistą nuo vėžio. Projektas atnaujina priešvėžinio junginio, vadinamo 9-dezoksisibiromicinu, tyrimus , or9DS, kuris ankstyvaisiais bandymais buvo veiksmingas prieš keletą vėžio rūšių. Projektas „Marilyn“ taip pat siekia pakeisti narkotikų tyrimo ir išleidimo būdą. The projekto pasiūlymas paaiškina:

„Socialinis tikslas yra parodyti, kad taikomieji farmacijos tyrimai gali būti finansuojami naudojant sutelktinio finansavimo modelį ir kad rezultatai gali būti paskelbti viešai, nepatentuoti. Galiausiai socialinio tikslo tikslas yra paskatinti gamintojus nebrangiai gaminti narkotikus, gerinant prieigą prie šių vaistų “.

Sibiromiciną, pagrindinį 9DS junginį, aštuntajame dešimtmetyje iš pradžių tyrė Sibiro mokslininkai, manydami, kad jis gali gydyti vėžį. „Tai yra toksiškas junginys, kurį gamina dirvožemio bakterijos ir kuris veikia sulaikydamas DNR replikaciją. Todėl jis turi priešvėžinės chemoterapijos potencialą “. paaiškina „Project Marilyn“ pasiūlymą. Tačiau jie nustatė, kad jis yra kardiotoksinis ir sukelia stresą širdžiai, ir nutraukė jų tyrimus. Projektą 9DS sukūrė Barbara Gerratana Merilendo universitete, Koledžo parke, kai ji sukūrė metodą sibiromicino analogams be deguonies atomo gaminti, kuris, manoma, sukelia kardiotoksiškumą. Deguonies molekulės pašalinimas pašalino šalutinį poveikį ir iš tikrųjų padarė vaistą efektyvesnį.

Tada Gerratana įsidarbino Nacionaliniame sveikatos institute ir negalėjo tęsti tyrimų. Vaistų kompanijos vargu ar rėmė tyrimą, nes ji jau paskelbė savo rezultatus be patento. Kadangi darbas nebuvo patentuotas, jis dabar yra viešas. Štai kur atsiranda Yonemoto. „Kodėl reikia gaminti vaistus be patentų?“ Tinklalapis Indysci.org klausia.

„Kai Salkas ir Sabinas išgydė poliomielitą, jie nepatentavo vakcinos. Atėjo laikas sukurti patentuotą priešvėžinį vaistą XXI amžiui. Kaip ir šiandien farmacijos pramonėje, taip ir programinės įrangos pramonėje istoriškai dominavo didelės kompanijos ir firmos kodų bazės. Šiandien plačiausiai pasaulyje naudojama operacinė sistema - „Android“ - yra atvirojo kodo. Kiekvienas gali nukopijuoti ir pritaikyti kodą, kad atitiktų konkrečius poreikius, arba patobulinti kodų bazę visai bendruomenei. Naršydami žiniatinklyje pamatysite turinį ir paslaugas, kurias teikia arba leidžia įgyvendinti atvirojo kodo projektai, pvz., „Linux“, „Wikipedia“, „WordPress“ ir kt. “

Tikimasi, kad 9DS projektas bus veiksmingas prieš melanomą, inkstų vėžį ir trigubai neigiamą krūties vėžį. Esant nedideliems molekulės pokyčiams, junginys taip pat gali būti veiksmingas prieš įvairius vėžio tipus. Projektas iki šiol yra gavęs įsipareigojimų už beveik 15 000 USD iš 50 000 USD tikslo ir beveik 2800 USD už Bitcoin; 50 000 USD finansuos projektą maždaug šešis mėnesius. Per tą laiką „Yonemoto“ planuoja pagaminti daugiau 9DS ir pateikti junginį į ksenografo tyrimą, kad būtų galima įvertinti vaisto veiksmingumą prieš tam tikras vėžio linijas (tai pasireikš „pelės vėžio išgydymu“, kaip paaiškinama svetainėje). .

„Tai yra kitas žingsnis kuriant vaistą ir svarbus žingsnis atliekant klinikinius (žmogaus) tyrimus“, - pažymi Yonemoto. „Jei gausime daugiau lėšų, pridėsime tam tikrų tikslų, tokių kaip tolesni ikiklinikiniai 9DS eksperimentai, 9DS analogų kūrimas ar kitos įdomios priešvėžinės idėjos“. Yonemoto ir vaisto „Tafamidis“ sumanytojo Evano Powerso vadovaujamas projektas pateiks nepriklausomą jo pastangų apžvalgą. Laidinis sužinojau, kad Yonemoto ketina paskelbti duomenis iš „Project Marilyn“ atvirai, galbūt „GitHub“, kur kūrėjai reguliariai rengia atvirojo kodo programinės įrangos projektus.

Laidinis Robertas McMillanas taip pat pažymi, kad Yonemoto lėšų rinkimo taktika prieštarauja standartiniam vaistų tyrimo metodui, tačiau tai yra grįžimas prie amžiaus vidurio vaistų, tokių kaip poliomielito vakcina, kuri buvo sukurta ir išplatinta be patentų apribojimų, tyrimo metodų. Yonemoto sakė McMillanui, kad „biologija tampa panašesnė į informatikos discipliną“, o perėjimą pagreitina technologinė pažanga, pavyzdžiui, kompiuterizuota žmogaus genomo seka.

Nors viso žmogaus genomo sekos technologija egzistuoja tik apie 15 metų, tvirtas jos užmegztas ryšys tarp kompiuterių mokslo ir biologijos leido mokslininkams vis labiau kreiptis į medicininių tyrimų projektus taip, kaip kūrėjai spręstų procesą projektuoti didelę programinės įrangos sistemą. „Google“ įkūrėjas Sergejus Brinas savo genų mutaciją garsiai vertina kaip klaidą savo asmeniniame kode, o paties „Google“ tyrimo, pvz., „Google X“ pradinio tyrimo, pagrindas yra „Google“ skaičiavimo sugebėjimo panaudoti medicinos tyrimus idėja. kitos įmonės, tokios kaip „Calico“, tirianti senėjimą, neurodegeneracines ligas ir vėžį.

Tyrinėdami genetiką, kaip jie gautų kodą, mokslininkai taip pat naudojasi mažomis kainomis, tokiomis kaip viso žmogaus genomo sekvencija, kuri dabar kainuoja apytiksliai 1 000 USD , kaip MIT aiškino DNR sekos aparatų gamintojos „Illumina“ prezidentas Francisas de Souza Technologijų apžvalga „EmTech“ konferencija. Jis apskaičiavo, kad šiais metais viso pasaulio mokslininkai nustatys 228 000 žmogaus genomų ir kad sekvencija dažnai naudojama įvairių vėžio rūšių gydymui. Illumina mano, kad spartių DNR tyrimų rinka gali siekti 20 milijardų JAV dolerių per metus, o pusė to bus susijusi su tokių ligų kaip melanoma, plaučių vėžys ar smegenų navikai tyrimais.

„GeneHub“ yra San Francisko startuolis, kuris paleido ir tada atšaukė a „Kickstarter“ kampanija sutelkti finansinę paslaugą, skirtą žmonėms pasiūlyti viso genomo sekos nustatymą. (Kampanija buvo atšaukta dėl prekės ženklų, kuriuos turi kita genomikos įmonė, kuriai reikės „GeneHub“ prekės ženklo.) Paleistis vis tiek ketina pasiūlyti pirmąją visiems prieinamą genomo sekos nustatymo paslaugą ir paaiškina jos motyvus:

„Per 11 metų nuo žmogaus genomo projekto pabaigos akademinės institucijos nedaug žengė į priekį suprasdamos nuostabią įvairovę, išreikštą žmonių genome. Vos suprantame, kaip jus sukuria jūsų genai. Ši problema nebus išspręsta laboratorijoje, nes jose trūksta dalijimosi duomenimis ir uždaro „skelbti ar žūti“ mentaliteto, bet suteikiant jums ir kitiems puikiems žmonėms galimybę naudotis savo genomu ir suteikiant jums galimybę tyrinėti, dalytis, analizuoti, ir kontroliuoti savo genomą. „

geriausias visų laikų koledžo imtynininkas

Nors „GeneHub“ tikisi sukurti verslą siūlydama genomo sekos nustatymą kaip paslaugą, jos siekiai taip pat atitinka Yonemoto siekį padaryti medicininius duomenis labiau prieinamus ir atvirus įvairių žmonių tyrimams. Lygiai taip pat, kaip kūrėjai daro savo programinę įrangą atvirą šaltinį tikėdamiesi, kad kiti galės dar labiau išplėsti jos galimybes, ir naujomis kryptimis, medicinos ir genetinių tyrimų pavertimas atviru ar plačiai prieinamu galiausiai gali sukelti svarbių atradimų tyrėjams, kovojantiems su vėžiu ir kitomis ligomis .

Tačiau ne anksčiau, nei ši unikali biologijos ir informatikos sankirta įveiks keletą iššūkių. Viena iš jų yra įvaizdžio problema: suvokimas, kad sutelktiniai finansuojami sveikatos projektai aplenkia tradicinį tarpusavio vertinimo procesą, kuris patikina mokslinius teiginius. „Imuniteto projektas“, „GoBe“ veiklos stebėjimo priemonė ir „Scanadu“ skautas suteikė tam tikrą nepasitenkinimą. Nors pradedantieji siekia demokratizuoti medicininę informaciją ir tyrimus, jiems bus labai svarbu įrodyti savo hipotezes ir parodyti savo vaistų ar technologijų potencialą.

Taip pat gali būti, kad atvirojo kodo mokslinių tyrimų projektai taip pat turės rasti būdą surinkti daugiau pinigų nei jie gali iš sutelktinio finansavimo, nes norint sukurti ir pagaminti vaistą reikia milžiniškų sumų. Gerai įgyvendinus tokias iniciatyvas, kaip „Project Marilyn“, siekiama ne tik parodyti mokslinį vaisto ar gydymo pagrįstumą, bet ir pritraukti daugiau mokslininkų ir investuotojų į projektą. Tai galėtų pradėti perspektyvias naujas tyrimų sritis ir galbūt sutrumpinti žinomai ilgą naujų vaistų ir gydymo kūrimo ir testavimo procesą - tai reiškia, kad kai „Yonemoto“ ar kitas tyrėjas užbaigs kitą svarbų vaistą nuo vėžio, jie galėtų tą naujovę iš laboratorijos paversti tikra - gyvenimo pacientai šiek tiek greičiau.

Daugiau iš „Tech Cheat Sheet“:

  • Šią savaitę 4 programėlės: „Open Source House“, „Smart Pan“ ir dar daugiau
  • Štai kaip technikos įmonės moka už visą tą jūsų naudojamą nemokamą programinę įrangą
  • Keturi didžiausi žaidimai, prasidedantys kitą savaitę